期刊简介
中国科协主管，中华医学会主办。本刊是传染病、 寄生虫病专业学术期刊。主要报道传染病与寄生虫病（包括临床各科内各种感染性疾病）领域领先的科研成果和临床诊疗经验及与传染科临床密切结合的基础理论研究，交流中医、中西医结合的临床经验，介绍新理论、新方法、新技术和国际上有关传染病（感染性疾病）研究的新进展。主要设有述评、专论、基础论著、临床论著、综述、讲座、临床病理（病例）讨论、国际交流、病例报告、会议纪要及国内外学术动态等栏目。主要读者对象为广大的传染病（感染病）科医师。
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首页>中华传染病杂志
- 杂志名称：中华传染病杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：1000-6680
- 国内刊号：31-1365/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 维普收录(中), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)
新疆地区人类免疫缺陷病毒-1感染者CRF07_BC流行毒株gag基因遗传特性
周素娟；米吉提·买买提；王发省；常燕玲；艾尼；芮宝玲；王丽；王昌敏；高眉扬
关键词：HIV-1, 基因产物, Gag, 聚合酶链反应, 进化速率
摘要：目的 分析新疆地区HIV-1感染者中流行的单一亚型CRF07_BC毒株的gag基因遗传特性.方法 对35例CRF07_BC亚型的HIV-1感染者分别于2011年9月(T1时间点)、2012年5月(T2时间点)、2013年2月(T3时间点)和2013年10月(T4时间点)4个时间点采集全血标本.为排除不同程度免疫功能对HIV-1基因变异的影响,使用流式细胞仪进行CD4+T淋巴细胞计数,并按照CD4+T淋巴细胞＜200/μL(重度免疫抑制)、200～500/μL(中度免疫抑制)和＞500/μL(无免疫抑制)分为不同免疫功能的3组.抽提标本RNA,套式PCR扩增gag基因片段,终将3组研究对象得到的4次序列进行基因离散率和进化树分析,并使用BEAST软件估算该地区CRF07_BC流行毒株的近共.同祖先株形成时间和平均进化速率.为排除HARRT对HIV-1基因变异影响,对HARRT组和非HARRT组进行基因离散率分析.结果 3组不同免疫功能的研究对象均呈现出在T1、T2、T3、T4时间点的组内和组间基因离散率依次升高的趋势.HARRT组和非HARRT组也均呈现出在T1、T2、T3、T4时间点的组内和组间基因离散率依次升高的趋势.进化树分析显示,同一样本的几次序列在进化树上聚集成一簇,大部分毒株均在T4时间点上独立分出一支;其近共同祖先株形成时间为10.9年[95％高后验密度(HPD):2.0～22.2年],平均进化速率为1.34×101替换·位点1·年-1(95％HPD:5.16×10-4～2.23×10-3替换·位点-1·年1).结论 新疆地区HIV-1感染者CRF07_BC亚型毒株会随着在一个地区流行时间的延长,加大该地区同一亚型内的基因离散率;CRF07_BC单一亚型内病毒株的gag基因进化速率相对文献报道的略慢.
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